Сюжет игры почти полностью повторяет фильм. Повествование ведётся от самого Артура.

Итак, молодой Артур отправляется в мир минипутов, чтобы найти легендарное сокровище своего деда. Вместе с Барахлюшем он отправляется на совет, но через минуту на деревню нападают осматы. Чтобы от них избавиться, Барахлюш предлагает отправится на Ферму моль-молей и освободить их. Но, придя на ферму (кружным путём), друзья узнают у стража, что всех моль-молей увезли осматы. Но он предлагает отправится в святилище моль-молей на Высоком Корне. Пройдя через хранителя Чтока и сад острых камней, друзья попадают к лифту. Но там их разделяет взрывом: Барахлюша забрасывает на Высокий Корень, Селения оказывается у катапульты, а Артур осёдлывает комара. Помогая друг другу, они выпускают всех моль-молей. Но из-за этого комар Артура теряет управление, и он падает. Упав, Артур достаёт из камня могучий меч и бросает его Селении. Втроём они противостоят гигантскому осмату.
Одолев осматов, друзья отправляются в путь. Пройдя туннель, они выбираются на поверхность. Сразившись с панчимолем (сколопендрой), друзья продолжают путь к станции. По пути они не раз видят летящих туда осматов. Когда они наконец добираются до станции, то видят, что её захватили осматы. Артур снова садится на комара и разрушает стену. В благодарность смотритель отправляет их в Некрополис, но из-за шмеля они падают в ручей. Артуру приходится спасать Селению и Барахлюша. После спасения герои оказываются на мосту над Водопадом Сатаны. Они продолжают искать дорогу, и вскоре они находят бетамоля (божью коровку). Но во время полёта их атакуют осматы. Друзьям удаётся спастись. После сражения Артур предлагает подняться повыше и осмотреться. Поднявшись, они находят нового бетамоля. На нём они добираются до поля маков, где и остаются на ночёвку.

Игрок играет, переключаясь между тремя персонажами: Артуром, Селенией и Барахлюшем. Только совместное действие поможет открыть дорогу дальше и решить определённые головоломки. В некоторых местах необходимо действие всех трёх персонажей. Из-за этого игра напоминает «Потерянных викингов».

Герои
Артур — десятилетний мальчик, который пришёл в мир минипутов, чтобы найти легендарные рубины. Ловок и проворен. Он может запрыгнуть на врага и пару раз ударить ему по голове. Может отнимать щиты у осматов. Используя корни и уступы, может забраться куда угодно.
Селения — принцесса минипутов, сестра Барахлюша. Владеет могучим мечом, и только она может пробиться сквозь ежевику. Также способна нанести мощный удар, атакуя осматов, на время сильно увеличивать скорость обычной атаки и использовать круговую атаку.
Барахлюш — принц минипутов, брат Селении. Владеет многофункциональным ножиком, из которого стреляет конфетками (впоследствии нож может выпускать три конфетки). Может произвести усиленный выстрел, который валит с ног любого врага. Также с помощью ножа Барахлюш может загипнотизировать улитку (хранителя Чтока), находить моль-молей или руны минипутов.
Противники
Хотя основными противниками являются осматы, есть пара второстепенных:
Улитки — врагами как таковыми не являются. Просто иногда выскакивают из разбивающихся раковин и взрываются.
Динь-дини — существа, похожие на растения. Если подойти слишком близко, то они хватают героя языком и похищают яйца. Победить их можно, скормив им шарик пыльцы, но они возрождаются.
Осматы — основные враги, вооружённые мечами-булавками. Когда они появляются, то закрываются ворота, и главная цель — отнять у них ключ. Бывают простыми и красноглазыми. И если простые - просто «пушечное мясо», то красноглазые заметно мощнее, и их надо относительно долго бить, пока их глаза не станут жёлтыми. Также удар по красноглазому осмату не сбивает его атаку.
Осматы-стрелки — бросают копья-булавки и выполняют роль снайперов. Стоят обычно на возвышениях или в труднодоступных местах. Могут быть поражены мощным выстрелом из ножика Барахлюша.
Летающие осматы — версия "реактивной пехоты", осматы с крыльями, быстро перемещающиеся по полю боя. Появляются с середины игры. Чтобы победить такого осмата, нужно два героя: один бьёт и обездвиживает, второй добивает. Обычно именно они являются носителями ключа.
Огромный осмат — гигантский осмат, вооружённый дубиной. Также появляется с середины игры. Как правило, является носителем ключа. На первом уровне выполняет роль босса. Победить его можно только втроём. У этого осмата два слабых места: тыл и голова. Любая его атака сбивает с ног и отнимает половину здоровья героя.
Осмат на комаре — эти осматы во множестве встречаются на уровнях, где Артуру приходится летать. Стреляют смоляными шарами. Убить их можно с двух попаданий. Если герои на земле, то такой осмат неуязвим (даже мощный выстрел не поможет). Но если запустить в него шарик пыльцы, то он на время выйдет из строя.